Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Serpina1cQ00896 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Serpina1cQ00896 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms