Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SeleQ00690 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SeleQ00690 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SeleQ00690 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms