Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga4Q00651 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms