Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa1Q00623 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms