Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F8a1Q00558 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms