Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax8Q00288 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms