Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PgrQ00175 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms