Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb4P99026 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms