Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab33aP97950 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab33aP97950 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab33aP97950 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab33aP97950 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab33aP97950 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab33aP97950 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab33aP97950 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab33aP97950 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab33aP97950 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab33aP97950 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab33aP97950 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms