Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
VegfdP97946 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms