Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pitx2P97474 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms