Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg1P97376 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg1P97376 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg1P97376 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg1P97376 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frg1P97376 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms