Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SmsP97355 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SmsP97355 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SmsP97355 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SmsP97355 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SmsP97355 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SmsP97355 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SmsP97355 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SmsP97355 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms