Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms