Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx3P81067 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx3P81067 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx3P81067 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms