Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx1P80205 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms