Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ext2P70428 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ext2P70428 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms