Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9xP70398 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9xP70398 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9xP70398 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9xP70398 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9xP70398 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9xP70398 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9xP70398 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9xP70398 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Usp9xP70398 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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