Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pitx1P70314 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pitx1P70314 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms