Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux2P70298 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux2P70298 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux2P70298 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux2P70298 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux2P70298 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cux2P70298 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms