Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stra8P70278 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stra8P70278 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stra8P70278 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms