Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NficP70255 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NficP70255 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NficP70255 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NficP70255 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NficP70255 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NficP70255 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NficP70255 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NficP70255 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NficP70255 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NficP70255 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NficP70255 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NficP70255 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NficP70255 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NficP70255 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NficP70255 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NficP70255 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NficP70255 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NficP70255 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NficP70255 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NficP70255 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NficP70255 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NficP70255 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NficP70255 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NficP70255 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NficP70255 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NficP70255 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NficP70255 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NficP70255 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NficP70255 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NficP70255 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NficP70255 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms