Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd13P70217 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd13P70217 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms