Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig1P70193 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms