Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbdsP70122 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbdsP70122 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SbdsP70122 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms