Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb4bP68372 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb4bP68372 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms