Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acta1P68134 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Acta1P68134 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms