Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps27aP62983 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27aP62983 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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