Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2lP62876 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2lP62876 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms