Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3cP62823 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3cP62823 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms