Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta2P62737 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms