Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrpd2P62317 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms