Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmo4P61969 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lmo4P61969 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmo4P61969 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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