Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r1P61809 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms