Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppfia3P60469 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppfia3P60469 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppfia3P60469 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms