Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims4P60191 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims4P60191 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rims4P60191 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims4P60191 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims4P60191 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms