Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Nup43P59235 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup43P59235 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup43P59235 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup43P59235 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms