Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms