Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P58686 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P58686 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P58686 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P58686 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P58686 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P58686 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P58686 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P58686 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P58686 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P58686 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P58686 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P58686 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P58686 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P58686 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P58686 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P58686 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P58686 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P58686 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P58686 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P58686 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P58686 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms