Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Strn4P58404 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strn4P58404 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strn4P58404 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strn4P58404 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Strn4P58404 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strn4P58404 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Strn4P58404 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strn4P58404 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Strn4P58404 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Strn4P58404 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms