Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrpa1P57784 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms