Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtnsP57757 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtnsP57757 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtnsP57757 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtnsP57757 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtnsP57757 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtnsP57757 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms