Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gsc2P56916 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms