Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn18P56857 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms