Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SmoP56726 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SmoP56726 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmoP56726 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmoP56726 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmoP56726 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SmoP56726 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SmoP56726 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SmoP56726 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SmoP56726 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SmoP56726 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SmoP56726 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SmoP56726 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmoP56726 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmoP56726 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmoP56726 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmoP56726 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmoP56726 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmoP56726 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmoP56726 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmoP56726 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmoP56726 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmoP56726 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmoP56726 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms