Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a3P56564 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a3P56564 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms