Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lim2P56563 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lim2P56563 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lim2P56563 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lim2P56563 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lim2P56563 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms