Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GemP55041 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GemP55041 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GemP55041 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GemP55041 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GemP55041 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GemP55041 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GemP55041 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GemP55041 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GemP55041 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GemP55041 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GemP55041 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GemP55041 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GemP55041 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GemP55041 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GemP55041 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms