Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acod1P54987 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acod1P54987 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acod1P54987 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 825.1 ms