Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PctpP53808 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PctpP53808 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PctpP53808 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PctpP53808 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PctpP53808 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PctpP53808 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PctpP53808 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PctpP53808 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PctpP53808 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PctpP53808 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PctpP53808 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PctpP53808 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PctpP53808 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PctpP53808 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PctpP53808 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PctpP53808 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PctpP53808 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PctpP53808 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PctpP53808 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PctpP53808 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PctpP53808 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PctpP53808 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PctpP53808 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PctpP53808 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PctpP53808 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PctpP53808 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PctpP53808 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PctpP53808 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PctpP53808 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PctpP53808 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms